Sis dans l'église vénitienne de San Francesco, il abrite des collections principalement issues de l'ouest de l'île, et incluant des découvertes du Néolithique à l'époque romaine : idoles, statues, inscriptions, armes, poteries, sceaux, pièces de monnaie, bijoux, etc.

Avec une collection couvrant largement l'histoire de l'île, ces archives sont les plus importantes du pays après les Archives Générales de Grèce (ouvertes tous les jours de 8h00 à 13h00 sauf les samedis, dimanches et jours fériés).

Sur le port vénitien. Vous découvrirez dans ce musée un panorama de l'histoire maritime de la Crète, de l'antiquité à la Bataille de Crète de 1941.

La loggia vénitienne abrite ce musée, où l'on verra des découvertes archéologiques de la région, ainsi qu'une collection de pièces de monnaie.

Le musée est situé au centre de Rethymnon, dans un bâtiment du XVII^ième siècle. Ses collections comportent plus de 5 000 pièces issues de donations, d'achats et de prêts. Ces éléments sont présentés de manière thématique : les collections d'art populaire incluent tissage, travail de l'osier, broderie, costumes, céramiques, travail du métal, cultures et artisanat traditionnels. Les collections historiques incluent quant à elles des documents historiques, des photographies, des cartes, des armes, des bannières et des pièces de monnaie.

L'un des musées les plus importants de Grèce. C'est ici que sont réunies la plupart des découvertes de l'époque minoenne. Céramiques, sculptures, sceaux, statuettes, bijoux, objets métalliques... Vous y admirerez aussi les originaux des fresques découvertes à Knossos, de même que le sarcophage entièrement peint d'Agia Triada.

Essentiellement consacré à l'histoire de l'île, des époques byzantine (330 après J.C.), vénitienne et turque, le musée présente aussi des documents historiques plus récents. Également, une riche collection dédiée aux arts populaires : costumes locaux, textiles, sculptures sur bois, broderie, ainsi qu'une représentation d'une maison crétoise traditionnelle.

L'église principale du monastère et la chapelle des Agii Deka abritent aujourd'hui une collection d'œuvres représentatives de l'art byzantin et post-byzantin. (ouvert du lundi au vendredi, de 10h00 à 13h00).

Collection de découvertes archéologiques minoennes issues du site de Malia, du cimetière de Fourni et du sanctuaire d'Anemospilia.

Le musée provient, à l'origine, d'une collection privée constituée durant trente ans par Giorgos Markakis, professeur d'ophtalmologie, conférencier et écrivain. Les bâtiments eux-mêmes font partie de l'exposition : entièrement construits avec des matériaux naturels (pierre, bois, argile) sous la direction de leur fondateur, ils témoignent du sens architectural de celui-ci, et présentent une esthétique unique dans la région. Les collections balaient un large éventail : instruments agraires, broderies, plantes locales. (Ouvert tous les jours sauf le samedi du 1ier avril au 31 octobre, de 09h00 à 14h00)

Le musée présente des trésors archéologiques de 6 000 avant J.C. au II^ième siècle après J.C., issus des fouilles effectuées dans la moitié est de la Crète.

Collection archéologique incluant des marbres, des statues et des inscriptions de la période gréco-romaine.

Ce musée archéologique abrite des découvertes minoennes faites à Sitia, Zakros, Petra, et Palekastro.